厦门大学台湾研究院教授陈孔立9月22日出席“两岸关系新跨越”学术研讨会时发言指出，由于两岸在政治难题上的分歧，导致两岸关系制度化搁浅，两岸应持“双向思维”，以平等的态度把两岸之间的问题看成是和平发展的全球战略的组成部分，由双方共同面对、共同解决。他还认为，两岸政治关系制度化在相当长时间内，很难向前推进。

　　陈孔立指出，经过“两岸协商制度化”达成的“服贸协议”无法付诸实行，是两岸关系制度化未完成的明显例证，表明两岸关系制度化已经出现搁浅，大陆方面希望两岸关系“全面制度化”，在政治关系方面则强调政治定位、和平协议、军事互信等，而台湾方面强调“先经后政”，长期以来不想谈政治关系问题，能拖就拖，其学界亦提出两岸政治关系制度化的不少主张，如强调“中华民国制度化”的政治定位制度化，参与国际组织制度化，和平制度化与和平协议以及“习马会”即两岸领导人会晤的制度化，台湾方面希望两岸能够“平起平坐”，而大陆却认为这是违背了“不造成‘两个中国’‘一中一台’”的原则。

　　陈孔立指出，过去两岸不同程度上存在着‘单边思维’，即一切从有利于己方的角度出发，而非从有利于两岸关系和平发展的前景出发，这不能破解两岸面对的重大政治难题。他提倡“双向思维”，认为两岸应以平等的态度，把两岸之间的问题看成是和平发展的全球战略的组成部分，从两岸人民的共同利益着想，由双方共同面对、共同解决，而不是由一方来‘纠正’、‘说服’另一方，或是单方面地指责对方不了解自己，甚至要求对方完全接受自己的看法。

　　此外，陈孔立认为，在两岸“确立共同的价值观念”之前，两岸政治关系制度化问题，包括两岸政治定位、台湾“国际空间”、两岸和平协议、两岸军事互信机制等等，都无法实现，两岸学界可以继续讨论，但也无法取得共识，即使在个别问题上有一些共识，也不会形成制度化。

　　陈孔立亦直言，马英九当局关心的只是“不武制度化”，对其他问题不感兴趣，迫于台湾内部的各种压力，他们连两岸文化协议都不敢谈，更难谈得上两岸政治关系制度化的议题。

　　陈孔立认为，两岸关系制度化是两岸必须走的路，但要把有关问题排排队，确定先后缓急，不要急于求成，否则就会适得其反，此外，既要制度化，就必须经历确立共同的价值观念、制定规范、建立机构的完整过程，一步步完成制度化的过程。